“其次,里德还发现,RNA的生产过程中,除了DNA、RNA聚合酶和碱基原料以外,还存在一个叫做TFIIIA的转录因子。它就像一个指挥官,告诉RNA聚合酶从DNA图纸的哪里开始组装。这就解释了为什么所有体细胞都共享一个基因组,但血红蛋白只能在红细胞内合成,胰岛素只能在胰岛β细胞中生产。”
“最后,艾伦·克鲁格发现,TFIIIA之所以可以特异性结合DNA,是因为它有个DNA识别模块。其中数十个氨基酸围绕在游离的锌离子周边,形成一个像手指一样的立体结构,这就是锌指。”
“很好。”卢赫连连点头,“然后呢?”
“然后?然后不就是一个锌手指能够识别三个碱基序列,把多个锌手指组合在一起,连接上核酸内切酶,不就能完成特异性识别并且咔嚓一下子剪断DNA了嘛?”
菜菜说完得意地眨着眼睛望着卢赫,好像在说:快表扬我。
“没了?”卢赫追问道。
();() “没啦呀。3个碱基表征一个氨基酸,理论上氨基酸也就只有64种,找到对应的64个锌手指,排列组合在一起,实现对靶标基因的精确定位。”
“唉。。。”卢赫叹气道,“姑娘你还是太年轻。言之易,行之难。我之前总跟你说锌指组装起来很难你知道为什么吗?”
“对呀!为什么呀?按原理来看,组装锌指不就是有手就能干的事嘛?”
“因为锌指之间是会互相干扰的。比如,你想要组一个能特异性识别GGTAAGATC的锌指。你以为是把GGT、AAG、ATC对应的三个锌指粘起来就行了吗?不是的。锌指之间会互相干扰,GGT的锌指会稍微摸到AGG的A一点,同样ATC的锌指也会暗戳戳地碰一下AGG的G,反之亦然。这相当于有效的识别序列被模糊成了GGNNANNTC,使特异性结合的能力大大下降,脱靶能脱到姥姥家去。”
菜菜听后蹙起眉头,嘟着嘴默默沉思。
“不过克鲁格找到了一个十分‘优雅’的方式,解决了这个问题。每一个3碱基序列都有可能对应多个锌手指,早在30年前就积累出大几百个了,总能找到两个能和谐共处的锌指。对于GGTAAGATC来说,可以先找到和谐相处的GGT-AAG(A),再找到和谐相处的AAG(B)-ATC,最终再搜寻出一个AAG(C)使它和AAG(A)、AAG(B)结构类似,问题就解决了。”
“通过6个人就能认识全世界?”菜菜惊叹道。
“没错,就是这个道理。”卢赫点头称赞,“不过,虽然原理简单,但做起来很难。实际的锌指组装是一个极其困难且复杂的过程。我现在让你立刻要到马花腾的联系方式,并通知他赶紧V我50,你办得到吗?”
菜菜信服地摇了摇头。
“所以啊,这就是圣加蒙锌指专利的核心之处,快速设计和组装锌指。”
“那你之前为什么总说自己用锌指编辑火焰龟很难,是试了几千次冒碰出来的?”菜菜毫不客气地击中了卢赫的痛处。
卢赫把浴巾蒙到脸上,含糊不清地说:“这就是问题所在啊。圣加蒙垄断锌指技术这么多年,好不容易专利过期了,还仿不出来。现在想来,虽然我当初试了那么多次才成功,但倘若我不用他们的平台,我跟金哥永远都没有缘分相见。”
菜菜眼见着面前这个好不容易走出阴霾,又重归垂头丧气的人,连忙安慰道:“那我们买一套吧,买一套他们的组装平台。现在靶标基因位点和锌指数据都是现成的,你再组装一个编辑出金哥二世不是分分钟的事嘛?”
但她没想到是,卢赫听后竟更加抓狂了,他把浴巾从脸上拽下一半,忧郁地望着菜菜,“首先,他们不卖了。其次,卖我我也买不起。最后,我没有编辑金哥的锌指数据。当初在南州湾里德实验室用的他们的平台,是一体化的。你给它DNA序列和靶标基因,试剂盒一塞,它直接给你出合成结果。这是为了保护他们的商业机密。”
卢赫说完,两人同时陷入了沉默。他们现在的处境完全就是:我有一个很棒的想法,但我还差一个程序员。
卢赫的头顶冒着蒸蒸的水汽,水汽袅袅上升把头顶的白炽灯晕得一片模糊。他就这么仰着头,对着灯光发呆。
忽然,他的脑海中忽然闪过一瞬他看过不久的一篇论文。那是一篇用CRISPR技术编辑模板小鼠的文章,里面的对照组用的是锌指,通讯作者的单位是南州湾大学。当初里德实验室买下锌指平台时是永久授权,他们现在还在用!
他心中立刻冒出一个大胆的想法,“你说,我回到南州湾大学借着他们的平台去把金哥二世、莉莉白和皮卡丘一起造出来,这怎么样?”
菜菜狐疑地瞥了一眼卢赫,好似对方是一个异想天开的傻子:“您老年纪太大估计都已经忘了,里德那栋楼里可是有个三级实验室,进楼需要一道安检、一道刷卡闸机和一道人脸识别。请问您是打算偷摸溜进去还是硬闯呀?”
卢赫笑着摇头,“都不是,我是五好青年,我打算正大光明地进去。”
“那要怎么进去呀?”
“考进去!”
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